2020年10月30號，中國醫學科學院系統醫學研究中心蘇州系統醫學研究所吳愛平課題組在Briefings in Bioinformatics發表了“Compositional diversity and evolutionary pattern of coronavirus accessory proteins”論文。該研究開發了一個半自動的冠狀病毒基因組組成注釋工具CoroAnnoter，系統解析了所有冠狀病毒附屬蛋白的多樣性組成和進化模式。
新冠病毒（SARS-CoV-2）是繼SARS病毒（SARS-CoV）和MERS病毒（MERS-CoV）后第三種導致人類嚴重疾病的冠狀病毒。如此多樣的致病性冠狀病毒的出現，也提醒人們有必要去系統探索冠狀病毒群體的基因多樣性組成，特別是毒株間差異顯著的附屬蛋白的組成圖譜和分子進化關系。本研究開發了一個半自動的冠狀病毒注釋工具CoroAnnoter，并應用于39種冠狀病毒代表株的基因組結構注釋。研究表明，不同類型冠狀病毒毒株的附屬蛋白個數差別巨大，介于1-10個之間，其中SARS-CoV-2和SARS-CoV具有最多的附屬蛋白，分別為9個和10個。附屬蛋白在冠狀病毒的四個屬（α、β、γ和δ）中具有顯著的屬內保守性和屬間多樣性。本研究不僅提供了一個冠狀病毒基因組標準化注釋工具，還為冠狀病毒附屬蛋白的組成和進化研究提供了一個綜合參考圖譜，為冠狀病毒的功能多樣性研究提供了有效支持。
圖：冠狀病毒附屬蛋白組成圖譜
本研究工作得到中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程(2016-I2M-1-005)，國家重點研發計劃(2016YFD0500301)，國家自然科學基金(31900472)等項目的資助。蘇州系統醫學研究所吳愛平研究員為論文通訊作者，商敬哲博士為論文的第一作者。
論文鏈接：https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa262/5943788
文字|系統所
