醫學與健康科技創新工程

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【醫學與健康科技創新工程項目進展快報第196期】

血液病醫院陳俊仁/姜爾烈/郭曄完成大規模造血干細胞移植后免疫重塑路徑描繪

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2023年1月2日,中國醫學科學院血液病醫院(中國醫學科學院血液學研究所)陳俊仁教授、姜爾烈主任、郭曄主任醫師和中國科學技術大學第一附屬醫院孫自敏教授團隊聯合在American Journal of Hematology《美國血液學雜志》期刊在線發表題為“The Composite Immune Risk Score predicts overall survival after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation: a retrospective analysis of 1838 cases”(綜合免疫風險評分預測異基因造血干細胞移植后的總生存率:基于1838個病例的回顧性分析)的研究論文。該研究基于成人和兒童移植患者免疫重塑系統動力學數據集(NICHE-SKIRT)進行數學建模,可視化描述患者移植后的免疫穩態重塑過程,開發綜合免疫風險評分計算器以預測異基因移植后患者生存。

免疫重塑對移植結局至關重要。但既往研究往往存在研究對象數目較少(通常少于200例患者)、隨訪時間較短(移植后一年或更短)、患者年齡段單一(僅成人或僅兒童患者)、造血干細胞來源單一(骨髓、外周血或臍帶血)以及沒有整合移植后的多個免疫變量等問題。目前仍能實時、可視化追蹤患者移植后的免疫穩態重塑過程,且缺乏可以在臨床上廣泛使用的免疫穩態重塑量化評估工具。

該研究回顧分析了中國醫學科學院血液病醫院(中國醫學科學院血液學研究所)及中國科學技術大學第一附屬醫院在2012年到2020年接受造血干細胞移植的1945例患者的共11150次免疫學數據,涵蓋了廣泛的移植類型(包括自體移植107例,臍帶血移植561例,同胞全相合非臍血移植729例,單倍體非臍血移植443例,無關全相合非臍血移植89例,無關不全相合非臍血移植16例)。研究團隊運用Manifold Learning算法對高維度、多時間點免疫學數據降維,并繪制患者造血干細胞移植后免疫重塑路徑。

研究發現,移植后的前兩個月細胞數量恢復以CD8+ T細胞為主,隨后NK細胞、CD8+T細胞、CD4+T細胞和B細胞廣泛恢復,免疫重塑個體異質性在移植后約60天達到最大。

通過生存分析聯合Grid-Search優化策略,經交叉驗證發現移植后91–180天的免疫學特征可以預測異基因移植患者生存。為了尋找一個與“體質指數BMI”一樣簡單的計算方法,該研究通過整合八個關鍵免疫學指標,提出了易于臨床使用的綜合免疫風險評分(Composite Immune Risk Score, CIRS)來預測患者造血干細胞移植后的生存情況。CIRS在訓練集可以很好地預測全因死亡(HR = 2.69, P < 0.0001),并在獨立的驗證集(HR = 3.64, P = 0.0014)及外部測試集(HR = 2.44, P = 0.0087)得到證實。研究團隊還開發了可公開訪問的網絡工具— SKIRT計算器(https://skirt-calculator.shinyapps.io/skirt-calculator/),幫助臨床醫生評估患者移植后免疫重塑進展。


該研究是目前發表的規模最大的異基因造血干細胞移植后免疫重塑的隊列研究。造血干細胞移植后免疫重塑路徑的描繪及SKIRT計算器的開發可以幫助臨床醫生對移植患者進行分級管理,重點加強高風險患者的臨床監測,進而提升患者術后生存。近年來,中國醫學科學院血液病醫院(中國醫學科學院血液學研究所)信息與資源中心基于血液病專病高維度多模態數據資源庫,打通臨床信息和科研數據的信息共享與管理,提高血液學領域大規模數據集中統計分析能力,為開展高水平創新研究、促進數據科學和臨床醫學的交叉融合提供了堅實保障。

該研究獲得中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程(2021-I2M-1-001、2021-I2M-1-073)、天津市醫學重點學科(專科)建設項目(TJYXZDXK-017A)、天津市自然科學基金重點項目(20JCZDJC00410)、細胞生態海河實驗室創新基金(HH22KYZX0034)和國家重點實驗室自主課題(Z20-01)的支持。中國醫學科學院血液病醫院(中國醫學科學院血液學研究所)信息與資源中心首席技術專家陳俊仁教授、干細胞移植中心姜爾烈主任、兒童血液病診療中心郭曄主任醫師和中國科學技術大學第一附屬醫院孫自敏教授為共同通訊作者。曹易耕主治醫師、鞏曉文研究實習員、馮雅慧研究實習員、博士生王銘洋、碩士生胡鈺、劉會蘭主任醫師、劉雪鷗助理研究員、齊賽兵技師、季艷萍住院醫師和劉芳主治醫師為并列第一作者。

原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajh.26792

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