2022年8月3日，中國醫學科學院血液病醫院（中國醫學科學院血液學研究所）程濤教授、高欣副研究員合作在Nucleic Acids Research《核酸研究》在線發布了題為“ABC portal: a single-cell database and web server for blood cells”（ABC數據庫：一個對血液單細胞數據進行交互式探索和再分析的數據庫）的研究論文。該研究基于以往工作基礎創建了首個包含人和小鼠的血液單細胞數據庫。
血細胞/免疫細胞在人體正常生理和病理狀態下都具有重要的功能，單細胞技術極大地推動了血液與免疫系統的研究。2017年，在中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程支持下，程濤教授聯合國內外學者在國內率先牽頭啟動了血液細胞圖譜（Atlas of Blood Cell，ABC）研究計劃，旨在以血液系統為突破口，建立系統全面的細胞參考目錄，為血液系統及相關疾病的致病機制和精準診療奠定基礎。五年來，研究團隊取得了許多重要原創成果，大量單細胞研究的涌現為本領域研究者提供了寶貴的數據資源。但由于原始數據需要下載整理、分析處理和缺乏細胞類型注釋等原因，阻礙了這些數據資源的有效使用。因此，建立一個血細胞/免疫細胞的共享數據庫，系統性收集整理、注釋這些數據，并提供交互式的再分析工具，將為研究者探索和研究血液生理和血液疾病提供數據資源和分析工具。
ABC portal 數據庫 (http://abc.sklehabc.com) 是ABC研究計劃的重要組成部分，共計收錄了國際上公開發表的198套人和小鼠的血液/免疫相關的單細胞轉錄組數據集，涉及文獻150篇，其中國內研究工作的貢獻率占比高達11%。該數據庫涵蓋了血液/免疫細胞的發育、分化和疾病相關的大量數據，數據來源覆蓋了骨髓、外周血、胎肝等各種造血組織。為了方便用戶對數據進行探索分析，所有數據都使用人工矯正后的單細胞參考數據進行了統一注釋。
ABC portal提供基于網頁的交互式分析模塊，提供基因表達、細胞比例、細胞相互作用和疾病相關的基因特征分析。特別是，ABC portal支持基于樣本信息的個性化的樣本篩選，細胞類型篩選，并對篩選后的數據進行進一步分析；支持跨數據集的比較分析。交互設計簡潔易操作，分析內容多樣，并且可以設置個性化參數以滿足不同的數據分析目的。ABC portal為血液和免疫學研究者提供了一個對海量單細胞數據進行交互式探索和再分析的數據庫，為血液生理和血液疾病的研究提供了豐富的數據資源和工具。
該項目獲得中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程（2021-I2M-1-040，3332021093）、國家重點研發計劃（2021YFA1100900，2021YFC2500300）和國家自然科學基金（81890990，81730006，32000469）等基金的支持。中國醫學科學院血液病醫院（中國醫學科學院血液學研究所）程濤教授、高欣副研究員為共同通訊作者。中國醫學科學院血液病醫院（中國醫學科學院血液學研究所）高欣副研究員為第一作者。
原文鏈接：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkac646/6654411?login=true
